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UST 과학기술연합대학원대학교

Why UST

UST VISION 2033 UST의 비전과 목표를 확인하세요!

PROUDUST

창조적 교육환경 조성을 통한 자긍심 있는 USTian 양성

UNIQUE
DIFFERENT
PROFESSIONAL
Excellent
세계 최고의 교육 경쟁력 확보

창의인재 발굴 및 USTian化
UST21 교육시스템 확립

Entrepreneur
산학연 일체화 대학 실현

UST-출연(연)-산업체 협력 강화
출연(연) 간 협력 강화
출연(연) 과학기술 기반 창원지원 강화

Global
국가연구소대학의 글로벌 위상 정립

브랜드 가치 제고
협력 네트워크 강화

Smart
창조적 지식경영 체제 확립

첨단 교육환경 조성
경영 효율성 제고

본문 시작

소개

생명과학전공은 제4차 산업혁명의 핵심 키워드인 다양한 생명과학 기술의 실현에 기여할 전문인력의 양성을 목적으로 한다. 오믹스 기반의 생명현상 이해와 생체내 신호전달의 이해에 필요한 제반 기술을 습득한다. 아울러 생명체 발생 및 분화 원리, 다양한 인체질환과 연관된 원인 유전자 및 개개인의 유전자변이를 파악한다. 이를 위하여 인간 및 실험동물을 대상으로 거시적인 유전체 및 후성유전체, 단백질체, 생물정보학 등의 다학제적인 연계 연구를 지향하고 있다. 유전체, 후성유전체, 단백질체, 세포체, 생물정보학 등의 핵심기술군을 중심으로, 대단위 인프라를 이용한 현장실습 위주의 교육을 실시한다.

세부전공
세부 전공명, 전공내용으로 구분하여 안내합니다.
세부 전공명 전공내용
기능유전체학 기능유전체학은 유전자 기능규명에 필요한 제반기술을 습득하고 이를 활용함으로 생명체의 발생/분화 원리를 파악하고 다양한 인체질환과 연관된 유전자의 기전 규명하여 미래의학 실현에 기여한다.
생명정보학 생명정보학(Bioinformatics, 생물정보학)은 다양한 분야의 지식을 융합하여 대용량 정보를 효율적으로 다룰 수 있는 지식을 연마하는 학문으로 향후 생명과학은 물론 정보 기반의 개인유전체 및 맞춤의료 시대의 핵심 연구분야이다.
생체분자과학 생체분자과학은 인간의 삶의 질 향상을 위한 질환 치료제 및 진단법 개발을 위해 생물학과 화학의 통합적 이해에 기초하여 생체분자를 연구하는 분야로, 의약품(화합물/단백질의약품/천연물의약품 등) 및 진단법 개발 분야의 전문가를 양성한다.
단백체구조생물학 단백체 구조생물학은 단백체학과 구조생물학을 기반으로 분자 구조 규명에 필요한 첨단 생물학 분석기술을 습득하고, 다학제 간 연구를 통해 단백체 구조생물학 분야의 전문인력을 양성하고자 한다.
Category

교과목명(국/영문)

유전체빅데이터 (Genomics Big-Data)

교과목 상세정보

커리큘럼-교과목 상세정보
캠퍼스, 학위과정, 학점, 이수구분, 강의형태, 강의방법, 주관교수로 구분하여 안내합니다.
캠퍼스 한국생명공학연구원 스쿨
학위과정 통합과정 학점 3
이수구분 전공강좌 강의형태 전공강좌(단독강의)
강의방법 국문강의 주관교수

강의개요

강의개요
강의목표, 교재 및 참고문헌, 수업운영방식, 과제물, 성적평가방식으로 구분하여 안내합니다.
강의목표 개인유전체, 희귀질환, 암유전체에서 생산된 Whole-Exome/Genome Sequencing 데이터의 정보분석 및 데이터의 해석 방법을 실습을 병행하며, 이론중심으로 최신동향을 포함하여 초중급 수준에서 강의함. 기말고사는 오픈북으로 각 단원별로 추출된 50여개 문항에 대한 답을 작성하여 제출하며, 매 강의 시간에는 강의요약자료를 LMS에 업로드함(출석확인).Bioinformatics analyses of Whole-Exome/Genome Sequencing data from Personal Gemes, Rare Disease, Cancer Genomes and their interpretation. Some of short time practices of analysis pipelines will be presented. Final exam is to write down summaries of 50 questions into three lines.
교재 및 참고문헌 PPT교재
수업운영방식
과제물
성적평가방식

주별강의계획

주별강의계획
주차, 계획으로 구분하여 안내합니다.
1주차 최근 NGS 플랫폼 선호도 및 동향 분석
2주차 DNA 라이브러리 제작 및 FASTQ 파일 포맷, 데이터베이스에 대한 이해
3주차 기초리눅스사용법 / 표준유전체, 표준유전자 모델에 대한 이해
4주차 NGS를 이용한 희귀질환 및 진단 응용의 이해
5주차 표준유전체 서열 indexing, uBAM 변환, BWA-MEM 맵핑 이해 및 실습
6주차 Read Group, sorting, duplicate removal, fixmate 과정 이해 및 실습
7주차 SAM 파일 포맷 이해 및 GATK IndelRealigner의 이해 및 실습
8주차 개인유전체의 이해, pysam/tabix의 이해 및 실습
9주차 HaplotypeCaller 이해 및 실습, gVCF의 활용
10주차 JEXL expression의 이해 및 filtering 실습, snpsift를 이용한 텍스트 파일 변환
11주차 NGS를 이용한 암유전체 정보분석의 이해
12주차 snpEff를 이용한 gene annotation 및 UCSC genome browser의 custom track을 활용한 가시화 실습
13주차 Pathogenicity Prediction and Genic Intolerance
14주차 드노보어셈블리 정보분석에 대한 이해
15주차 집단유전체 정보분석에 대한 이해
16주차 기말고사